Фізико-хімічний інститут ім. О.В.Богатського НАН України створений в 1977 році. Засновником і першим директором інституту був академік АН УРСР О.В.Богатський. З 2021 р. інститут очолює член-кореспондент НАН України Кузьмін Віктор Євгенович.

Інститут є головною організацією Науково-технічного комплексу, що створений у 1983 р., до складу якого також входять Спеціальне конструкторсько-технологічне бюро з Дослідним виробництвом та Науково-технічний інженерний центр проблем водоочищення і водозбереження «Водообробка».

В Інституті створені та розвиваються Одеські наукові школи в галузі органічної, біоорганічної та супрамолекулярної хімії (засновник – академік АН УРСР О.В.Богатський) та в галузі аналітичної хімії (засновники- академік АН УРСР М.С.Полуектов, член-кореспондент АН УРСР В.А.Назаренко).

Роботи вчених Інституту відзначені Державними преміями в галузі науки і техніки СРСР (1952, 1980, 1987) та України (1991, 2003, 2008), премією Ради Міністрів СРСР (1990), премією ім. Л.В. Пісаржевського АН УРСР (1978), премією ім. А.І Кіпріанова НАН України (2010), преміями президентів академій наук України, Білорусі та Молдови (1998, 2000), преміями Президента України для молодих вчених (2006, 2009, 2011), премія Кабінету міністрів України (2011), премія Верховної Ради України (2012), премія НАН України для молодих учених і студентів вищих навчальних закладів "За кращі наукові роботи" (2013).